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Sanger测序中的测序酶:生产与应用

2024-10-07

Sanger测序,也被称为双脱氧链终止法,是一种经典的DNA测序技术,其发明者Frederick Sanger因此技术获得了1980年的诺贝尔化学奖。这种测序方法基于DNA聚合酶的DNA合成过程,通过添加双脱氧核苷三磷酸(ddNTP)来终止DNA链的延伸,从而得到一系列不同长度的DNA片段,这些片段的序列信息可以通过电泳分离和检测来确定。本文将详细介绍Sanger测序中测序酶的生产与应用。


测序酶的生产

在Sanger测序中,DNA聚合酶是关键酶类之一。它负责在DNA模板链的指导下,将脱氧核苷酸(dNTP)逐个添加到引物的3'端,从而合成新的DNA链。然而,Sanger测序的特殊性在于,它使用了双脱氧核苷酸(ddNTP)作为链终止剂。ddNTP与普通dNTP的区别在于其3'端缺少一个羟基(-OH),这使得ddNTP在DNA合成过程中不能形成磷酸二酯键,从而导致DNA链的延伸被终止。


测序酶的生产通常涉及基因工程技术和发酵工艺。首先,研发人员会从合适的生物体中提取DNA聚合酶的基因,然后利用基因工程技术将其克隆到表达载体中。接着,将表达载体导入到宿主细胞(如大肠杆菌)中,通过发酵培养使宿主细胞大量表达测序酶。最后,通过分离纯化步骤,可以得到高纯度的测序酶用于测序反应。


SGT-V1.8.jpg

博上生物自研的SG Terminator V1.8测序酶


测序酶的应用

在Sanger测序中,测序酶的应用主要体现在DNA链的合成和终止过程。具体步骤如下:


      1.DNA模板制备:从待测序的DNA样品中提取出目标DNA片段,并进行PCR扩增,得到足够的DNA模板。

      2.DNA合成反应:在PCR扩增反应中,加入四种不同的dNTP和一种ddNTP。由于ddNTP可以随机地终止DNA链的延伸,因此可以得到一系列不同长度的DNA片段。

      3.电泳分离:将得到的DNA片段进行电泳分离,使不同长度的DNA片段得以分离。

        4.检测:通过放射自显影等技术对电泳结果进行检测,从而确定DNA序列。

值得注意的是,随着技术的发展,现代Sanger测序已经广泛采用荧光标记技术来代替传统的放射自显影技术。荧光标记的ddNTP在测序反应中被掺入到新合成的DNA链中,不同种类的ddNTP被标记上不同颜色的荧光染料。这样,在电泳分离后,就可以通过检测荧光信号来确定DNA序列。


Sanger测序的优缺点

Sanger测序作为一种经典的DNA测序技术,具有读长长、准确性高等优点。其测序读长可达1000bp左右,准确性高达99.999%。然而,Sanger测序也存在一些缺点,如测序成本高、通量低等。这限制了其在大规模基因组测序中的应用。


尽管如此,Sanger测序仍然在遗传病的分子检测、单基因病、线粒体病、单核苷酸多态性检测等方面发挥着重要作用。此外,将Sanger测序技术与分子克隆技术相结合,还可以用于DNA甲基化位点的检测等研究领域。


测序酶在Sanger测序中发挥着至关重要的作用。通过基因工程技术和发酵工艺生产的测序酶,具有高纯度、高活性等特点,能够满足Sanger测序对酶的需求。随着技术的不断发展,相信测序酶的生产和应用将会更加成熟和完善,为生命科学领域的研究提供更加有力的支持。